庚戊（康熙九年）
辛亥（康熙十年）
壬子（康熙十一年）
癸丑（康熙十二年）
十一月，平西王吳三桂據雲南、四川、貴州以叛，遂陷湖南岳州諸郡縣，稱大周元年。初，平南王尚可喜疏稱歸老遼東，而留其子安達公之信襲鎮廣東，朝議許之，並令舉家歸旗。平西、靖南相繼疏請，俱報可。至是平西反。乃命平南、靖南仍留駐鎮。時耿繼茂已死，耿精忠襲王。三王交通逆命，雖復停留，而反謀益決。
甲寅（康熙十三年）
三月十五日，耿精忠據福建傳各官入府議事，伏甲執總督范承謨、巡撫劉秉政以叛。知府王之儀、建寧同知喻三畏走出被殺。范承謨被拘。以劉秉政為偽統制使，鄉宦蕭震為偽布政使，自稱「總統兵馬上將軍」，移檄各府州縣，俱望風而降。
十九日，耿精忠檄至泉州，提督王進功是夜縱諸將焚燒南街、西街譙樓，殺掠到晚，紳庶無遺，傳檄各屬縣皆降。興化鎮馬惟興劫興化，守備郭維藩劫惠安，獨同安城守張學堯、晉江水師營李尚文所部無犯。
耿精忠再遣通事黃鏞至臺灣。初，耿精忠將拒命，遣鏞通鄭經請師為聲援。至是，又遣鏞見鄭經，請以舟師由海上出江南，而己統陸師出浙江。鏞回言，海上船不滿百，兵不滿萬，精忠始輕之。
耿精忠以黃梧為偽平和公。梧病疽，受印不數日，疽壞而死；其子黃芳度襲封，管其兵。
駐防漳海道陳啟泰黨於范承謨，與精忠有隙，聞變，先殺家屬十餘人，乃自縊。陳為官則甚貧，於死則甚烈。
漳浦鎮劉炎、海澄鎮趙得勝俱降耿。福寧鎮吳萬福貪刻失將士心，謀拒耿，眾不從。耿精忠遣偽都尉曾養性督兵至，萬福出降，養性誘殺之，並其兵，遂乘勝長驅至平陽，總鎮蔡朝佐降，溫、處二府望風皆下。
四月，潮州總鎮劉進忠降耿，密請師，耿令劉炎率兵會之，夜攻同城，續順公沈瑞並其兵。精忠召王進功，至福州，留之，徵其兵。
鄭經遣協理禮官柯平至福州報命。時耿聲勢已振，謾應曰：『鄭世藩來，甚喜，但兵多餉少，各分地自戰可也』。由是兵端遂起。
鄭經親軍侍衛馮錫範、鎮將劉國軒率舟師數十，兵數千，先至廈門。
耿精忠檄諸路兵出關。黃芳度遣黃翼領兵千人應命。趙得勝不從，與馮錫範陰約，以海澄歸命於鄭經，隨將兵進攻同安。
王進功之入福州也，耿精忠調張學堯鎮泉州，以化尚蘭代守同安。鄭經兵至，尚蘭迎降。獲學堯家眷。學堯聞變趨回，施福引之，俱降鄭經。
五月，鄭經至思明州。以趙得勝為左提督，封興明伯；張學堯為左先鋒鎮，化尚蘭為仁武鎮。遣人至精忠處，議撥地方安插船隻兵丁，精忠不答，又禁買竹木麻繩修船等物，遂成仇隙。至是，耿精忠聞同安之失，乃遣王進率步卒千餘人入鎮泉州（王進號王老虎，原任漳州副將）。時提督五營兵將不肯應調。王進至，與城守賴玉相詰納，用提標守備戴國用為爪牙，勒王進功家眷入省。耿精忠復遣兵接應，兵將至，進功之子藩錫與其屬楊青等議先發以制之。
六月初一日，王藩錫以提督夫人之命召諸將議事，誘賴玉、戴國用、李尚文等執之，率兵攻王進。進走登塗門樓，意氣自若，提標兵散而無統帥，相持至晚不決。進恐海船至，更深整隊出城西去。
初三日，藩錫等殺賴玉，分其屍。初四日，絞殺戴國用，釋李尚文，迎鄭經入城。鄭經以藩錫為指揮使，暫理提督軍務。
黃芳度襲殺漳州城守劉豹。豹，耿氏所署也。鄭經遣人諭之，芳度遂降，封德化公，授前提督，漳屬錢糧聽其徵給。芳度終不自安，遣人間道齎密疏入京。
七月，平南王尚可喜遣兵圍劉進忠於潮州。耿精忠不能救，進忠納款於海上。鄭經遣援勦後鎮金漢臣率舟師援之。以進忠為右提督，封定虜伯。
九月，耿精忠以步騎二萬，遣漳浦新降總兵劉炎同王進攻泉州。鼓行至惠安，肆行焚掠。鄭經命劉國軒督諸鎮，並統五營兵禦之，對壘逾旬，進退屯楓亭，列營二十餘里。
十月，國軒兵至塗嶺，嚴陣會戰。王進見前陣皆新募之兵，直前奮擊之，兵皆懼怯死戰。國軒令許耀分兵襲其後，焚其營壘，進兵大敗。國軒追至興化城外，三日夜而還。
十一月，偽周吳三桂遣禮曹錢點聘於海，值鄭、耿交惡，回報。復遣禮曹員外周文驥至海和解。
劉炎在漳浦，不降鄭經，密請援於耿逆。耿遣兵會之。至平和，鄭經檄黃芳度擊走之。耿逆復遣其親軍都尉徐鴻弼從間道入漳浦。鄭經以馮錫範、趙得勝督諸軍攻之。徐鴻弼、劉炎會雲霄鎮劉成龍合兵迎戰於羅山嶺。右虎衛何祐揮軍擊之，鴻弼等大敗，走回城。馮錫範以紅夷大砲擊入城中，劉炎等大懼，同鴻弼、成龍俱出降。
十二月，趙得勝督諸軍援潮州，與平南王兵戰於黃岡，大破走之，潮圍始解。初，進忠被圍，金漢臣一軍殲焉。進忠極力守禦，將及半載。至是，廣兵燒營而遁。
鄭經分設六官，名曰協理：洪磊為吏官，楊英為戶官，鄭斌為禮官，柯平為刑官，楊賢為工官，兵官缺。置六科都事、都吏、察言司、承宣司、賓客等司。陳永華為總制留守，兼管勇衛，馮錫範為侍衛（二衛皆親軍）；薛進思為左武衛，劉國軒為右武衛，何祐為左虎衛，以施福為五軍；其左右先鋒及諸鎮營皆聽五提督調遣。凡文武事宜，皆贊畫參軍陳繩武、侍衛馮錫範主之。
初，鄭經之來思明州也，兵饟取給於東寧。洪磊承其父洪旭遺命，助餉銀十萬兩，至是兵眾餉多，轉運不給，乃以六官督比紳士富民以充之。以鄭省英為宣慰使，總理各府州縣錢糧。百姓年十六以上、六十以下，每人月納銀五分，名曰「毛丁」；船計丈尺納稅，名曰「梁頭」；特設各府鹽司，分管鹽場，以給兵食。
乙卯（康熙十四年）
正月，耿賊遣張文韜至鄭賀正議和，送船五隻。鄭經遣禮官鄭斌報之，約以楓亭為界。自是鄭、耿交好。
二月，永春馬跳峰寨民呂華不服鄭氏徵派，薛進思圍之。三閱月不下。知縣鄭時英諭之出降，釘殺之，家族發淡水充軍。
續順公沈瑞駐饒平，劉進忠攻之不克。廣兵來援，何祐遇之於百子橋，破走之，瑞出降，改封懷安侯。
流洪經略承疇胞姪士昌、天恩、天倫及眷口於東寧之狼嶠，從公論也。流前進士楊明琅及眷口於狼嶠，以其過崇禎帝梓宮不下馬，又修南安縣志以海上為海寇也。後皆死於流所。知南安南縣事劉祐云：『洪經略未必盡是，鄭國姓未必盡非』。鄭經悅其言，召之，已逃回籍矣。
五月，劉進忠請海師南下，鄭經許之。初六日，鄭經入海澄，遣鄭斌入漳，慰諭黃芳度，或束兵入見，或統兵隨征。芳度終不受命，密調回黃翼出關之兵。耿逆移檄召之，亦以疾辭。鄭經遂定攻城之計。
劉國軒率諸鎮兵至潮，與進忠規取屬縣之未附者。安達公尚之信悉力守禦，相持日久，糧乏兵病。之信調兵十餘萬盡銳來攻。國軒自新墟寨一日一夜退至鱟母山，以餘糧露載車上，宣慰使洪磊懸金以賞有功，軍心稍定。進忠與國軒議曰：『之信大兵必從小路而來，出我不意，須得勁將當之；惟何祐可任，然不可言其故，恐其心怯。子可嚴陣以待，而余將騎兵背城以為應援』。國軒從之。是夜見敵營從大路火光照耀，進忠發大砲擊之，見火光不動。進忠曰：『是空營也，我兵可安寢以待』。次日，之信率兵從小路而來，何祐見大隊突至，欲退不可，冒死直前，奮勇擊之，無不以一當百。之信大敗走。國軒等窮日夜追之，殺死不計其數。是役也，祐以饑率數千破敵兵數萬，由是何祐之名，大振粵東。祐，別號「何錐子」。
六月，鄭經自海澄移檄萬松關；黃芳度令其下俱薙髮，率兵拒守，不降。遣其兄芳泰突圍入粵請援。鄭經進攻不利，援勦後鎮萬宏雲梯登城，中砲死。鄭經迺築長圍以困之。調何祐從潮州先攻平和縣，守將賴陞降，諸屬縣皆下。
十月，海澄公標將吳淑以漳州降於鄭經。初，淑投誠屬公標，黃梧待之厚；將死，呼淑托曰：『吾兒年少，君可保全之』。及城被圍日久，淑謂其弟潛曰：『我本鄭氏降將，公雖待我厚，我負罪於先藩實深。今世藩待我眷族，恩尤加重，豈可反圖逆命』？遂以初六日開城出降。鄭經兵入，芳度倉皇投開元寺井而死。獲其將黃翼、蔡龍、朱武、張濟、戴麟、陳驥、黃琯等，皆斬之。沒其家。剖黃梧棺戮尸斬首，並芳度首揭竿以徇眾。有議發梧祖塋者，鄭經曰：『罪止其身，與先死者何預』？不許。後朝命贈芳度為忠勇王。時芳泰往粵求援，會其兄芳世由汀州至永定，亦以是日破永定縣，聞漳州陷，迺大掠而遁。鄭經以吳淑為後提督，吳潛為戎旗二鎮。
十一月，鄭經令龔淳往日本取回鄭泰所寄之銀。淳乃泰委寄之人，並執有收票可據。先是，兩家紛爭，日本王皆不肯與；至是，番人皆混開支銷銀凡四十五萬，僅得二十六萬而回。
丙辰（康熙十五年）
正月，鄭經以右虎衛許耀、前衝鎮洪羽等率師會在潮諸將攻取廣東州郡。
二月，平南王昏病日甚，會偽周師克肇慶、韶州等處，廣州人人自危。駐韶諸軍聞報，燒營而遁。劉國軒、劉進忠、何祐等分南北兩路而進。碣石鎮苗之秀軍程鄉，其妻在汛，遣人迎降，仍勸之秀納款，鄭經許其回鎮碣石。國軒等水陸並進，圍惠州，攻博羅不下，旋下長樂、新安、龍門等縣。之信窮蹙，遂乞降三桂。三桂封之信為輔德公，檄讓惠州於經。之信檄提督嚴明撤守兵回廣，遣使餽弓馬、幣帛通好於鄭氏。鄭經迺以國軒鎮惠州。東莞守將張國勳亦降鄭經，經以為後勁鎮。自是鄭與吳分界而守。
五月，耿逆調汀州鎮劉應麟兵出關，應麟不從，密通款於鄭經。經乃遣吳淑統兵，馳書於精忠，言欲假道汀州以出江右。耿賊遣兵防城，應麟懼其圖已，率所部出掠瑞金、石城。吳淑兵至，應麟與之合兵共攻汀州，遂下之。鄭經以應麟為前提督。
七月，鄭經調劉進忠出師，進忠稱疾不行。進忠自潮州定後來見，鄭經待之禮意疏略，見左右用事者皆錄錄，知不足與有為。及取汀州，歎為失計。至興寧，與諸將不協，流言日起，遂稱病回潮，陰為自守之計。
九月，耿賊師出浙江者為總督李之芳所扼，多被摧敗，朝命遣康親王提兵乘機入閩。耿賊兵出江西者為總督蔡毓榮及滿洲兵移駐防兵合力拒之，耿兵大敗，廣信遂失。既而棄建昌不守，大勢已潰。又聞汀州已破，耿賊益憂內顧，諸將遂密謀，詐作耿賊投誠獻關。耿賊聞變，大懼，收王進、范承謨、蕭震絞殺之，欲乘船奔海，為都尉徐文耀所脅，不得出城。遣王進功回泉州取救兵，密囑曰：『我忍死以待也』！然延建已失，不得已於十九日薙髮迎康親王入福州。後耿賊入京，與徐文耀及諸將領皆伏誅。
興化守將馬成龍以城降於鄭氏，鄭經令許耀率兵赴之。
十月，鄭經令許耀督諸軍進取福州，駐師烏龍江；許耀驕縱，諸將不服，飲酒嬉戲，不知軍事。大兵渡江，有議於半渡擊之，不聽；既登岸，倉皇出戰，先鋒死鬪，不能分兵救援，及少卻，又不殿後，引兵先走，委棄輜重器械不可勝計。鄭經乃遣趙得勝、何祐屯興化以代之。
耿賊檄曾養性等自溫州航海回閩，朱天貴以舟師降於鄭氏，其餘逃入福州。鄭經遣奇兵鎮黃應邀擊之，獲巨船數十艘。
十一月，精忠邵武守將楊德獻款於吳淑，淑入據之，始請盟。
十二月，大兵至邵武，吳淑禦之。時大雪嚴寒，諸軍冒雪涉溪拒戰，皆大凍，不能支。遂棄邵武，退劄汀州。大兵進至建寧縣，薛進思守汀，聞之驚懼失措。劉應麟願傾貲餉兵固守，進思猜疑不從，棄城而走。應麟奔潮州依劉進忠，發憤病死。
平南王尚可喜於九月病故，之信遣使報訃，並請其妹奔喪。妹，沈瑞叔母也。鄭經許之，並遣使弔喪。偽周封之信為輔德親王。
丁己（康熙十六年）
正月，大兵至興化。時鄭軍銳氣已喪，何祐又與趙得勝不睦，疑其納款於我，戰敗不救，得勝死之，何祐奔回泉州。
二月初九日，大兵至泉州。鄭氏守將林定無備，城陷，標將林孟、參宿營謝貴死之。林定素與民相安，逃於民間，削髮走免。諸軍潰散。
十九日，大兵至漳州。鄭經倉皇登舟，至海澄，棄而不守；至廈門，欲回東寧，百姓號哭攀留。角宿營吳桂整兵防守，泉賴以安。繼而餘眾稍集，迺遣水師防衛分汛而守。
鄭經祭趙得勝，親臨哭之。斬薛進思（原姓名斐德），許耀綑責。耀病痢，不數日死。何祐、吳淑戴罪自效。
鄭經遣諸將家眷搬回東寧。王進功、沈瑞、張學堯等陸續起程。劉炎以母老病，至外洋勒兵劫船，乘風下碣石衛，依苗之秀；後投誠至京，流徙寧古塔。
三月，鄭氏諸將退集思明州。時兵餉不給，迺分汛南北地方，措餉召募。以前虎衛林陞、水師樓船中鎮蕭琛等駐晉南及定海、福寧一帶地方；以後提督吳淑、揚威前鎮陳昌、戎旗一鎮林應、奇兵鎮黃應等駐同安至揭陽、潮陽一帶地方。
漳浦巫者朱寅挾左道，詭稱朱三太子，聚集海上殘兵二百餘人，於十九夜襲泉州，攀堞而上，鳴鼓揚旗，從開元寺前至西街。守兵以為海師復至，迺於雙門前發一大砲。寅迺抽回出城而去。人以為神，附者日眾，屢戰皆勝，蔓延於漳、泉屬縣，凡深山窮谷岩寨，無所不到，派糧以食。頭裹白布，時人謂之「白頭賊」。
六月，劉進忠擁兵觀望。鄭經遣戶官至潮徵餉，不應；買運，又閉糴，獻款於偽周。尋歸王朝，磔死燕市。
劉國軒在惠州，尚之信既歸命，孤城難守，鄭經遣水師迎之，迺率所部航海而歸。
朝命以黃芳世襲封海澄公，授汀漳總鎮。公標守備黃蘭授海澄總鎮。芳世請兼水師提督，許之。芳世至閩，驕傲，專用北兵，人心不附。
三桂將韓大任據守吉安，大兵圍之經年，無援，迺造小舟於城內，乘夜以繩引舟，截江渡兵，潰圍走入閩界，欲下海，有信通於鄭氏。
十月，鄭經遣何祐等至南靖小溪收兵，吳淑等至長泰，扎天成寨以遙應之。大任意以糧盡，就閩省投誠。後歸旗，旋從大兵征噶爾旦，衝陣而死。
十二月，大兵圍吳淑於天成寨，朱寅率眾來援，吳淑迺突圍而出。
康親王遣漳、泉二知府同泉紳黃志美等照朝鮮例與鄭氏議和，鄭經不從，亦無報使。
戊午（康熙十七年）
正月，泉州提標兵巡界，駐日湖鄭氏水師四營陳陞擊之，大為所敗，標兵乘勝侵掠東石等處。
二月，鄭經以劉國軒為中提督，總督諸軍，後提督吳淑為副。初十日，國軒督軍至海澄攻玉州，我守將劉宗降；徇三■〈氵义〉河、福滸皆下。十八日，進取江東橋。我守將王重祿、呂韜等奔潰，遂燒斷橋梁以絕漳、泉大路。漳州援兵至，國軒分兵擊敗之。三戰三捷，軍聲大振。二十三夜，取石碼，獲我守將劉符、楊朝宗，遂軍於祖山頭，以逼海澄。我副都統孟安等自潮來援，國軒退屯石碼，築垣拒守，仍分兵屯漳州郭外。我提督段應舉自泉州來，寧海將軍喇哈達自福州至。平南將軍賴哈自潮州來，先後應援。國軒倏水倏陸，我滿漢諸軍疲於奔命。
三月初一日，國軒列陣郡東赤嶺，我兵背城迎戰。鄭氏前虎衛林陞一軍當其鋒，殺傷相當。朱寅統兵扎天寶山以牽漳兵之勢，黃芳世擊敗之；寅遁入長泰。國軒樹柵雙橋一帶，離漳數里。滿漢諸軍會議，以一股同黃芳世扎水頭山灣腰樹，一股扎鎮門安砲以斷其往來水路。國軒偵知，十一日黎明焚營撤兵。漳兵意其遁也，少頃，舉帆直抵水頭登岸，涉嶺進戰。芳世素不知兵，又與滿將不協；吳淑攻之，戰敗墜馬，遇救得免，走入漳城，病月餘死。
自水頭之敗，海澄餉道阻絕，段應舉會綠旗兵及滿洲將軍滿兵數萬，列營祖山頭。十八日午刻，國軒兵至，應舉揮兵迎敵，何祐少卻。江勝、吳淑等繞出祖山頭之背，國軒督勁卒登山，直衝滿漢兵。滿漢兵敗走，眾大潰。國軒又以疑兵截漳州大路，滿漢兵棄輜重，自相蹂踐，奔入海澄。國軒連夜令軍士鑿塹，一人一尺，引江水環城圍之，外又鑿溝數里，沿堤兩岸，安砲守之。由是內外阻絕。
是月，吳三桂以初三日稱帝於衡州，國號偽周，僭元昭武。
四月，朝命召總督郎廷佐入京，以布政司姚啟聖代之。勒巡撫楊熙致仕，以按察司吳興祚代之，調江南提督楊捷代段應舉。援兵四集，屯筆架山以救海澄。
五月，劉國軒以筆架山南小寨懸崖，狀如掛燈，俗呼「燈火寨」，下臨大溪，順流可通海澄，問誰可扼守？吳淑請行。乘夜率兵進寨，天明，寨柵完備。初十日，滿兵發砲攻擊，連夜不絕。淑令軍士穴地藏身，無死傷者。馳報國軒，以為乘夜發砲，意不在寨，當別防之。信至，滿漢兵齊至振（振字衍）祖山岳嶺，破林彪、張鳳二營，鳳戰死。又進攻林陞營。國軒援兵至，姚啟聖之子姚儀統韓大任降兵，以牛載土囊填溝，至第三重，國軒發大砲齊擊之，死者無數，滿漢騎兵多填於塹，遂進去。時京中上諭有能救海澄者及城中兵將有能拔圍而出者，皆重賞。奈國軒鑿塹通潮，圍至數重，不可復救矣。
六月初十日，國軒攻海澄，陷之，段應舉、穆伯希佛自縊死，黃藍不知所終，獲孟安、馬虎等滿漢官三十餘員，皆釋之，授銜給俸。滿兵千餘，遷之東寧。時城中滿甲二千，馬八千餘匹，綠旗城守兵二萬餘，圍八十三日，糧盡殺馬而食，馬盡，屑馬骨食之，死亡及泅水而出者過半。閩省震恐，諸援兵退守漳郡。
朱寅下海，封為蕩虜將軍，改名蔡明義，歲餘病死。
國軒議乘虛攻泉州，吳淑分兵下長泰縣。國軒兵至同安，都統雅大里走回泉州，擒鄉兵總黃朝光斬之，與何祐、江欽、楊德數十騎離隊伍先行，至泉城，循清源山至東嶽廟相視營地。城中兵不敢出。久之，隊伍始至，扎營於平地；城中兵終不敢出。
七月，國軒水陸並進。江欽攻南安，殺守將。諸縣守兵相繼棄城走，遂取南門橋銃城。載龍熕及大銃數十號攻南門城，城崩壞四十餘丈，盡為平地。城內再築短牆以守。我城守馬勝等以釘釘船板鋪於地上，兵入城無踔足處，損傷甚多。會天大雨，城竟不拔。鄭兵圍泉州兩月，援師四集。將軍喇哈達從漳平問道出安溪，巡撫吳興祚同浙江提督石某由白鴿嶺出永春，江南提督楊捷由廣橋進河市，三路會師，至南安，皆未敢向前。將軍又調水師林賢、黃鎬等出閩安鎮，遙為聲援。
八月，鄭氏水師鎮總督蕭琛守定海。林賢等舟師至，琛戰船不先期整頓，議以舟寡且小，欲據上流牽制之。水師五鎮章元鎮欲先發制人，率所部十舟進戰。林賢等擊之，元鎮眾寡不敵，阻風逐流，一軍盡沒，被擒入福省殺之。蕭琛不防備，遇敵大潰，退泊海山，遂妄報福州水師大至。鄭經遂令劉國軒退兵，以守思明。國軒於二十四日退兵下船，隔三日，城中兵始敢出。鄭經召回蕭琛斬之，以援勦左鎮陳諒、後鎮陳起明督朱天貴等水師防禦北船。
偽周主吳三桂病死衡州，孫世璠僭立。其侄應奇守岳州，驕而貪；大兵攻之，棄岳州遁回，於是湖南、雲貴皆不守，遂亡。
九月，劉國軒入江東橋，至長泰；滿漢兵遇之，皆披靡。乘勝長驅至耿精忠營，衝之，馬中砲，掀國軒墜地；有滿洲披甲前蒙國軒釋放，遇之，以己騎授國軒，始走免。滿洲主將詢知，怒而殺之。國軒出江東，守三■〈氵义〉河，列營觀音山，與滿漢諸軍營壘相望。
十月，時鄭氏漳泉縣屬盡棄，惟據守海澄。姚啟聖等難於復命，乃遣人至海議息兵安民，意欲得海澄也。鄭經竟不從。
十二月，再議遷界。甲寅之變，閩當遷民，悉復故土。丙辰，八閩已復，康親王疏請遷界累民，罷之。至是，督撫請再遷，從之。
己未（康熙十八年）
正月，時雖設界，而海汛往來內地，派糧如故，朝議上自福寧，下及詔安，三十里（內），量地險要，築小寨，屯守兵，限以界牆。由是瀕海數千里，無復人煙。先是，鄭氏諭思明州每月每戶輸米一斗，自二月起每戶再加一斗。劉國軒請停文武官俸，自出糧餉兵三月；從之。
三月，姚啟聖以果堂寨迫近江東橋，欲發兵守之。國軒偵知，同吳淑發兵入據其寨。漳兵至，擊走之。
鄭經自定海失守，以朱天貴守海壇，陳諒為水師提督。於廿九日早，各船乘南風迅發，進泊定海。福州集船百餘號，由五虎門而出。陳起明、朱天貴率熕船衝■〈舟宗〉而入，擊破十餘船，獲大烏船一隻。值大風暴起，福船收入五虎門，海船收泊海壇。
四月，陳永華啟請元子克■〈臧上土下〉為監國，時年十六，號曰「監國世孫」。
六月，鄭經命鄭時英駐東石督餉。時禁界鹽貴，居人多私來東石販鹽。時英獻策，欲掘沿海鹽埕，則利盡歸於海。鄭經迺檄林陞令楊忠率兵在潯尾掘南北場鹽埕。忠至深滬，舍舟登岸，發掘兩日夜，兵不就船。竿頭守將密請泉城大隊兵至，四面合攻，忠力戰不支，中砲沒於海，餘眾死傷逃亡過半。界禁既嚴，私販亦絕。
七月，國軒築潯尾寨，一夜而成。同安守將兵至，擊走之。復築丙洲城。由是同港八漿船不敢出。
朝命以萬正色為福建水師提督。正色，晉江人，歸誠授參軍，以四川朝天關之功陞岳州水師總鎮。湖南平，遂擢是任。
八月初，耿逆之變，漳浦人江機與楊一豹同時聚眾於江右依耿逆，及大兵克復江西，招降不從，攻之不能克，據皇禁山攻掠村社。至是，通款於海。鄭經授為征夷將軍，率眾入閩。建寧守將劉起龍禦之，陣傷敗回而死。機足跛，號「拐子」；一豹，青年勇壯；後投誠，俱流古寧塔。
九月，右武衛林陞汛守東石，取給軍餉。及楊忠敗死，林陞調兵隨征，僅以散卒二百餘人委施廷、陳申守寨。時有叛卒入泉城報知，城中發馬步數千，於廿五日四面環攻。施廷被創，陳申戰死，寨破，兵民赴海死者無數。我朝仍築三寨犄角以守。
十月，國軒離漳城五里而軍。時援漳滿漢兵共十餘萬，國軒兵只有萬餘，營壘咫尺相望，指揮自如，諸軍畏之如虎。國軒以果堂扼要重地。初八夜，率兵就果堂後版尾地方再築一寨。初九日，工未就，滿漢將軍提督集兵數萬齊至，銳不可當。國軒與吳淑、何祐、林陞、江欽（改江勝），兵不滿二千，奮勇死鬪。自午至申，衝擊數疊。國軒戒依寨，且戰且守。每次發砲，無不披靡。陣斬章京巴石兒等，其餘帶傷而遁者以數千計。自是奪氣，兵不敢出。國軒時縱卒數百人，皆持鹿銃，間以鳥槍，渡河衝擊，自登土阜，據胡床張蓋而觀之。滿漢兵遇之，無不摧破，皆堅壁自守不暇。又善用間諜，敵人情形，纖悉必知。時謂之「劉怪子」。
姚啟聖遣人至海上議息兵。又說國軒使罷兵就撫，國軒巽詞以謝。啟聖又設修來館，懸重賞。臺灣文武兵將來者，次第俱賞銀有差。降者日數百人。時諸軍缺糧，國軒一切不禁，頭領與兵丁，長髮與短髮，往來循環，而國軒兵額亦不缺。
十一月，吳淑守版尾寨。大兵築壘環攻，砲聲日夜不絕，淑處之宴如。身被傷，復染病，不以為意。時值陰雨，新築壘垣多壞，揮左右避之，自踞床而臥。初八夜二更，牆崩壓死，舁至思明，鄭經親臨哭之。以其次子吳天駟為建威右鎮，統其兵。
十二月，姚啟聖、吳興祚大集舟師攻廈門，題請浙粵水師剋期協攻。鄭經調各洋船私船配兵北上，以右武衛林陞為總督，右虎衛江勝、樓船右鎮朱天貴為左右副總督，率諸軍禦之。
庚申（廉熙十九年）
正月，水師提督萬正色及總兵林賢、陳賢、黃鎬、楊嘉瑞督舟師出閩安鎮，巡撫吳興祚率兵沿海援之。林陞分船三十號守海壇，自統船六十號退泊泉州臭塗灣。
二月，萬提督至海壇，海船俱退至泉州迎敵。萬提督至圍頭，朱天貴以七舟衝其■〈舟宗〉，所向無前。偶海風大作，萬提督乘風收各船入泉州港，而沿海岸上安砲，陸師防守。鄭氏各師無所取水，迺退至金門。
鄭經所親幸施福，密通姚總督，欲為內應。使授降兵數百人，挈眷來歸，乘機欲舉事。國軒諜知，啟鄭經收殺，併及施齊（福即施亥。齊，施將軍琅長子）。
鄭經議欲撥國軒兵三千，配小船直入泉州港，攻萬提督，使人持令箭抽兵。時兵已乏糧，盡皆潰散，國軒禁不能止。守海澄陳昌以城投誠。國軒至廈門，知勢不可為，收拾餘眾下船，百姓遮道跪留。
二十六日，兵變，據掠百姓。鄭經焚演武亭行營，盡率將士登舟。協理五軍吳桂收散卒據廈門，以待大兵。
二十八日，萬提督兵入思明州。
二十九日，鄭經至澎湖。朱天貴舟泊銅山，姚總督招之，遂投誠。二月十二日，鄧經回至東寧。
五月，東寧地有聲如驢鳴。半路店雨雹，大如雞子。
六月，鄭氏總制陳永華畫坐，見有衣冠甚偉者，自稱行災使者，欲借其衙署，約住三月然後去。永華設席張樂讌之，與之譚甚久，餘人不見也。即對衙署借之。
偽承天府豬生子，四耳三目，前二足向上。
鄭氏令曰：『十甲出丁壯一名』。
七月，陳永華病故。
十月，劉國軒營中豬生子，獸身人面。
十一月，白氣長數丈，見於西方。
辛酉（康熙二十年）
正月二十八日丑時，鄭經卒於臺灣偽承天府行臺。三十日，馮錫範、劉國軒調兵駐臺灣偽承天府，會六官議立嗣。經母董太妃與諸公子收監國印，克■〈臧上土下〉不肯與，擁兵自衛。群議以克■〈臧上土下〉迺乳母抱養之子，非鄭氏出，遂縊殺之；妻陳氏永華之女，亦自盡。
二月初一日，董太妃率世子克塽登位，時年十二歲，錫範之婿，百官朝賀畢，太妃起，出位，諭所以誅監國故，以世子付託馮、劉等，俾竭力匡扶，涕淚沾襟，眾心大慰。
董太妃以馮錫範為忠誠伯，劉國軒晉為武平侯（初以海澄功封武平伯，至是封侯）。大赦國中。以經第二子聰為輔政公，領護衛。
三月，以經第五子智為右武驤將軍，募兵。
四月，以經第三子明為左武驤將軍，募兵。
臺灣偽承天府火災。
五月，總督姚、巡撫吳、陸提諸、水提萬題為報明事：『本年四月二十二日，據舉人黃金從呈繳偽官傅為霖密稟，內開偽藩於正月廿八日病故，三十日縊死其監國長子欽舍，二月初一日立泰舍，叔侄相猜，文武解體，主幼國疑，時不可失等情到臣等。又據龍溪縣送到偽官廖康芳稟稱相同。俱與臣等密探相符。此迺天亡之時，但臺灣孤懸海外，統師遠勦，時地難測，非臣等所敢擅定。會同具題，請旨密示，臣等遵奉施行』。
六月十六日，董太妃卒。時協理刑官柯平已病故，陳繩武閒住，國事錫範主之，兵事國軒主之。
八月二十八日，中軍營火。
九月初三日，塗輕庭火。
十月，賓客司傅為霖通款事發，逃亡；廿八日，獲之。
十一月初一日，誅傅為霖及同謀宣毅左鎮高壽、都吏陳典威，盡殺其子弟；續順公沈瑞令自縊，家屬入官發配（禮官斌之女）。
總督姚上疏請攻臺灣，力薦內大臣伯施琅可任水師提督。萬提督言臺灣難攻，且不必攻。朝命召見施琅，仍以靖海將軍充水師提督，改萬正色為陸師提督代諸邁。
壬戌（康熙二十一年）
正月，施將軍出京至閩，於廈門各處調兵整船。劉國軒以銃船十九號、戰船六十餘號、兵六千人，撥諸將守澎湖；親身往來督視。
五月，姚總督率官兵至銅山候風。劉國軒至澎湖，臺灣列兵守各港澳。
六月，姚總督官兵回汛。
七月，劉國軒歸自澎湖。安平鎮火。施將軍題請專征，奉旨相機進取。
十月，歲飢。
十一月，國軒赴澎湖。
十二月，臺灣偽承天府火災，沿燒一千六百餘家，米價騰貴，民不堪命。國軒歸自澎湖。
癸亥（康熙二十二年、臺灣稱永曆三十七年）
正月，馮錫範備兵鹿耳門。
二月，米價大貴，人民飢死甚多。
五月，劉國軒率師至澎湖。
六月十四日，施將軍自銅山開船，大小五百餘號，姚總督撥陸兵三千隨征。十五日，到八罩。十六日，進攻澎湖。國軒列砲架巨艦各數十以待。諸將士皆望風逡巡，惟提標游擊藍理、曾成、張勝、正黃旗侍衛吳啟爵、同安游擊趙邦試、海壇游擊許英、銅山游擊阮欽以七船冒險深入鏖戰。國軒分兩翼，海艘齊出，四面合圍我師。施將軍琅恐數船有失，自將坐駕衝入，內外夾攻，敵稍卻。施將軍遂同七船隨流而出。時天色將晚，遂於西嶼頭洋中拋泊。
十八日早，次於八罩，以收諸軍。國軒聞而喜曰：『誰謂施琅能軍！天時地利，莫之能識，諸君但飲酒以坐觀其敗爾』！遂不設備。蓋澎湖自六月數起臺颶，無三日晴，而近澎諸島下有老古石，嵯枒若鐵樹，剛利無比，凡泊舟下札，遇風起立刻而覆，乘船者莫不危之。然停泊數日，浪靜風恬，亦天幸也。
十八日，移至虎井。施將軍泊小舟於內外塹峙間，密覘形勢。於是再申軍令，嚴明賞罰，令總兵陳蟒等領船五十號，從東畔峙內直入四角山；又令總兵董義等領船五十號，從西畔內塹直入中心灣，以為疑兵，示以若欲登岸者。將軍身率諸鎮將，部署大鳥船五十六號居中，分為八股排入，餘船以次而進，以為後援。指畫既定，俟風而舉。
二十二日已刻，南風大發，南流湧起，遂下令揚帆聯進。風利舟快，瞬息飛駛，居上流上風之勢，壓攻擠擊，無不一當百。又有火器、火船乘風縱發，煙焰彌天，大小海舟二百餘艘燒燬殆盡。國軒見勢蹙難支，遂乘小舟從北門孔道逸去，而全軍覆沒矣。是役也，惟前鋒林賢、朱天貴二船初入灣澳，天貴倏中砲而死，林賢被傷兩箭，餘軍皆無恙。
國軒敗回，群情洶洶，魂魄俱奪，惟有束手待斃而已。於是施將軍駐師澎湖，休勞士卒，收拾船隻，為進取臺灣之計。下令戮一降卒抵死。諸島投戈者數千人，皆厚恤之。有欲歸見父母、妻子者，令小船送之。降親相謂曰：『軍門恩澤，及我骨肉矣，死難報也』。歸共傳述之，臺灣兵民莫不解體歸心，惟恐王師之不早來也。
世子克塽與錫範、國軒泣相謂曰：『民心既散，誰與死守？浮海而逃，又無生路。計惟有求撫之著耳』。於是遣鄭平英、林惟榮、曹蜚、朱紹熙齎乞撫書表，於閏六月初八日至軍前，且求聽居臺灣。將軍曰：『削髮登岸，煌煌明旨也，何敢不遵！且若輩不親到軍門，而遣人代齎書表，詐也，為緩兵計耳』。復令曾蜚、朱紹熙回諭之。
七月十五日，世子復遣馮錫珪、陳夢煒、劉國昌、馮錫範、韓同、曾蜚、朱紹熙再至軍前，一遵嚴令焉。
故明寧靖王術桂，袞冕拜告祖宗，從容投環死。
施將軍令侍衛吳啟爵及筆帖式常在同馮錫範等前往臺灣宣佈德意，且密察臺灣虛實情形。吳啟爵於七月十九夜再至安平鎮，翌日見世子克塽，謂之曰：『足下遠居島嶼，原與三王不同（三王謂吳與耿、尚也）。三王，國家叛臣也，罪在不貰。足下三世仗義於海澨，亦人之所難也；今若嚮化歸德，使海宇廓清，朝廷必有格外殊恩，當不失爵祿也』。克塽曰：『使君惠及宗祐，敢不唯命是聽』。啟爵見國軒曰：『澎湖之役，天也，非人也。君雖挫衂以歸，而雄邁之風不衰。島上英傑，惟君一人耳！然所謂英傑者，在識時務，今大師臨門，或戰或降，決之一心足矣；何必遷延觀望，致誤大計乎』？國軒曰：『天威遠震，波臣革面，誰敢復有貳心？使君但安坐以待，必得契約以報軍門也』。蓋臺灣世子年幼，內政馮錫範主之，外政劉國軒主之。錫範庸懦豎子，進退無據，故相持未決焉。侍衛復謂國軒曰：『築舍之謀，終無成日。君但令兵民遵制薙髮，則大事可定矣』。國軒曰：『謹奉教』。遂下令兵民薙髮。錫範亦遂與世子遵繳冊印，而舉國歸降焉。侍衛回報將軍，將軍喜曰：『不待勞師而傾國效順，朝廷之福也』。即令侍衛馳驛入奏，並繳歸誠冊印。
九月初一日，侍衛至京。朝廷召見，特加慰勞。因問澎湖克捷事情，侍衛披圖指畫，備言渡海艱難，藍理等冒險進攻，凡兩舉而後得之。又言諸將士竭力用命，摧鋒血戰之苦；朝廷為之揮淚。因諭部臣曰：『閩師遠出海疆，冒險勦寇，非滇黔陸地可比，論功再加一等』。朝廷又問臺灣事，對曰：『臣至其地，視偽幼子未諳事，國事盡委於馮錫範、劉國軒。錫範懦而無斷，低徊猶豫，其實無能為也。劉國軒傾心歸命，挾以必從之勢，故臣得畢事而歸』。又問臺灣形勢，侍衛條對甚悉。問『提督重兵入險，得無有慮否』？對曰：『臺灣兵既敗之後，莫與共命者，但恐提督後至，〔議論不一，或至中變耳。若總督與提督能一心共濟，事可萬全。今提臣係督臣保舉，必無異心，指日可定；如謂奔敗之餘，再奮螳臂，敢拒巨轍，必無之理』。上悅，自解所御龍袍並賦詩以賜提督，加授靖海將軍，封靖海侯，以示酬庸焉。
八月十五日，施將軍統率大師至臺灣，百姓壺漿相繼於路；海兵皆預製清朝旗號，以迎王師。十月十七日，侍衛自京回至軍前，啣命申告，軍民莫不以手加額。
部議以臺灣番民雜處、山海要津，設總兵一員、副將二員統水陸官兵一萬鎮守之。設道官一員、一府、三縣，以統治百姓及番眾。府曰臺灣府，附郭為臺灣縣，〕（館藏抄本原缺數行，用海上見聞錄之文補之，並加〔〕以示區別）。南路為鳳山縣，北路為諸羅縣。建置既定，經畫事竣。
十月初六日，世子克塽、馮錫範、劉國軒、何祐等並眷口登舟。
十一月初六日，至泉州。初七日，往福省進京。
十二月，總督姚啟聖病死。
克塽至京，封為漢軍公；弟克■〈與上土下〉准開牛彔；叔鄭聰等俱以三品、五品官食俸，隨旗。馮錫範、劉國軒俱封伯。國軒隨補天津衛總兵，其子准開牛彔。
鄭氏自丁亥年起，至癸亥年亡，共三世，三十七年。
附錄一鄭芝龍受撫（谷應泰「明史紀事本末」卷七十六）
熹宗天啟七年六月，海寇鄭芝龍等犯閩山、銅山、中左等處。
芝龍，泉州南安縣石井巡司人也。芝龍父紹祖為泉州庫吏，蔡善繼為泉州太守。府治後衙與庫隔一街相望。芝龍時十歲，戲投石子，誤中善繼額，善繼擒治之，見其姿容秀麗，笑曰：『法當貴而封』，遂釋之。
不數年，芝龍與其弟芝虎流入海島顏振泉黨中為盜。後振泉死，眾盜無所統，欲推擇一人為長，不能定，因共禱於天，貯米一斛，以劍插米中，使各當劍拜，拜而劍躍動者天所授也。次至芝龍，再拜，劍躍於地，眾咸異之，推為魁。縱橫海上，官兵莫能抗，始議招撫。以蔡善繼有恩於芝龍，因量移泉州道，以書招之。芝龍感恩，為約降。
及善繼受降之日，坐戟門，令芝龍兄弟囚首自縛請命。芝龍素德善繼，屈意下之。而芝虎一軍皆譁，竟叛去。六年春，遂據海島，截商粟。閩中薦饑，望海米不至，於是求食者多往投之。七月，劫商民船，勢浸大，其黨攻廣東海豐嵌頭村以為穴。芝龍乃入閩，泊於漳浦之白鎮，時六年十二月也。
巡撫朱一馮遣都司洪先春率舟師擊之，而以把總許心素、陳文廉為策應。鏖戰一日，勝負未決。會海潮夜生，心素、文廉船漂泊失道。賊暗度上山，詐為鄉兵出先春後。先春腹背受敵，遂大敗，身被數刀。然芝龍故有求撫之意，欲微達於我兵，乃舍先春不追，獲盧游擊不殺。又自舊鎮進至中左所，督師俞咨皋戰敗，縱之走。中左人開城門求不殺，芝龍約束麾下，竟不侵擾。
警報至泉州，知府王猷知其詳，乃曰：『芝龍之勢如此，而不追、不殺、不焚掠，似有歸罪之萌。今勦難猝滅，撫或可行。不若遣人往諭退舟海外，仍許立功贖罪，有功之日優以爵秩』。興泉道鄧良知從之，遣人諭意。
懷宗崇禎元年春正月，工科給事顏繼祖劾福建總兵俞咨皋下獄。初，巡撫朱欽相招撫海寇楊六、楊七等。鄭芝龍求返內地，楊六紿其金不為通，遂流劫海上。繼祖上言：『海盜鄭芝龍生長於泉，聚徒數萬，劫富施貧，民不畏官而畏盜。總兵俞咨皋招撫之議，實飽賊囊。舊撫朱欽相聽其收海盜楊六、楊七以為用。夫撫寇之後必散於原籍，而咨皋招之海，即置之海。今日受撫，明日為寇，昨歲中左所之變，楊六、楊七杳然無蹤，咨皋始縮舌無辭。故閩帥不可不去也』。疏入，逮咨皋下於理。
三月，禁漳泉人販海。芝龍縱掠福建、浙江海上。
六月，兵都議招海盜鄭芝龍。
九月，鄭芝龍降於巡撫熊文燦。工科給事顏繼祖言：『芝龍既降，當責其報效』。從之。
二年春二月，海盜李魁奇伏誅。魁奇本鄭芝龍同黨，芝龍忌之，擊斬粵中。
夏四月，廣東副總兵陳廷對約鄭芝龍勦盜。芝龍戰不利，歸閩。不數日，寇大至，犯中左所近港，芝龍又敗。寇夜薄中左所。
四年春正月，上召廷臣及各省監司於平臺，問福建布政使吳暘、陸之祺：『海寇備御若何』？暘曰：『海寇與陸寇不同，故權撫之。但官兵狃撫為安，賊又因撫益恣，致數年未息』。上曰：『前撫李魁奇，何又殺之』？暘曰：『魁奇非芝龍比，即撫終不為我用。今鐘斌雖撫，亦反側不可保也』。上問：『實計安在』？祺曰：『海上官兵肯出死力，有司團練鄉兵，多設火器，以守為戰，勦之不難』。上問巡撫熊文燦，暘曰：『文燦才膽俱優，但視賊太易，故前有吉了之敗』。祺曰：『鍾斌與鄭芝龍勢不兩立，七月閒斌擾福州，撫臣計誘往泉州。前聞撫臣同芝龍討賊，僇其兄，賊遁去』。問廣東布政使陸問禮，對曰：『廣東海寇俱自福建至，舟大而多火器，兵船難近，但守海門勿令登陸，則不為害』。
五年冬十一月，海盜劉香老犯福建小埕，游擊鄭芝龍擊走之。
六年夏六月，海盜劉香老犯長樂。
七年夏四月，海盜劉香老犯海豐。
十二月，總督兩廣熊文燦奏道將信賊目陷。時文燦令守道洪雲蒸、巡道康承祖、參將夏之本、張一傑往謝道山招劉香老，被執。上以『賊渠受撫，自當聽其輸誠，豈有登舟往撫之理？弛備長寇，尚稱未知，督臣節制何事』？命巡按御史確覈以聞，已令文燦戴罪自效。
八年夏四月，福建游擊鄭芝龍合粵兵擊劉香老於田尾遠洋。香老脅兵備道洪雲蒸出船止兵。雲蒸大呼曰：『我矢死報國，亟擊勿失』！遂遇害。香老勢蹙，自焚溺死。康承祖、夏之本、張一傑脫歸。
八月，香老家屬六十餘人、部屬千餘人至黃華，降於溫處參軍。
十三年秋八月，加福建參將鄭芝龍署總兵。芝龍既俘劉香老，海氛頗息；又以海利交通朝貴，寢以大顯。
十六年冬十一月，設南贛兵三千，以副總兵鄭鴻逵統之。
十七年春正月，前兵科都給事中曾應遴薦副總兵鄭鴻逵緩急可用，詔益南贛兵二千，命鴻逵鎮守。踰年，鴻逵以舟師守鎮江，我大清兵南下，潰歸。鄭芝龍降。
谷應泰曰：海上亡賴奸民多相聚為盜，自擅不討之日久矣。蓋以魚鹽蜃蛤商舶往來剽掠其間者累千金，利則乘潮上下，不利則嘯聚島中，儼然以夜郎、扶餘自大，東南邊徼益騷然苦之矣。
泉州人鄭芝龍，筦庫之子也。年未弱冠，為海寇顏振泉所掠。振泉愛芝龍狀貌，因有寵。泉死，眾推為魁。然而龍特饒智數，桀黠喜持兩端，其他無絕殊者。
方其侵暴外洋也，輸金於楊六，緩追於洪先春；黃巾未破於曹公，赤眉約降於光武，其持兩端者一也。及其受撫內地也，私鬪則勇於魁奇，公戰則怯於廷對；殺陳餘於泜水，縱匡術於石頭，其持兩端者二也。又若擁兵閩越，援立外藩，定策功高，闔門橫玉，而乃陰懷首鼠，百計沮軍；滹沱既未合兵，東吳豈能遽下，居異人為奇貨，以澶淵為孤注，其持兩端者三也。又若關門既下，釋甲入臣，居第京師，招搖海上，曾無麟閣之功，但比遼東之豕；隗囂侍子而身反於外，延之在臺而子更舉兵，其持兩端者四也。
夫奉先之失在於去就輕脫，故依建陽別背建陽，依董卓則背董卓；牢之之敗在於天性反覆，故附道子則反道子，附元顯則反元顯。今芝龍以盜賊之雄，挾遨遊之智，而鷹眼不化，狼心已成，身在樊籠之中，志存江湖之上，一旦緩急，可得信乎？
然予又怪崇禎之初，芝龍既撫，銳意行金，織皮丹珀來目賈胡，明珠文犀至皆兼兩，是以薦剡頻上，爵秩屢敗，坐論海王，奄有數郡。人但知元龜象齒都自淮來，而不知寶玉大弓原從魯竊。若能卻盜泉之水，則不至奪君子之器矣；說在孔子之對康子也。
附錄二記荷蘭人據臺灣事（俞正變「癸巳類藁」一則）
萬歷中，臺灣為日本倭所據。末年，荷蘭紅毛人自西洋來，欲據香山，不可，則據澎湖，又不可，乃南據美洛居及葛留巴。以鴉片煙誘葛留巴，葛留巴人俱臃腑不能動，役於荷蘭。
既而荷蘭聚集精銳，攻香山，戰敗，揚帆東走至澎湖。使人行重賄於福建巡撫，援意大里亞人居香山故事，以求澎湖必得。巡撫使人善諭之，則投日本於臺灣，歲納鹿皮三萬，求臺灣互市也。適日本倭居臺灣者新奉天主教，遂許之，築赤嵌城以居，今安平鎮是也。
荷蘭既得地，即數數與日本倭搆爭。倭既染其教，爭不勝，盡屬東去，憤甚，盡誅其人之習天主教者，並約束琉球。而荷蘭據有臺灣，置揆一王亦不漢東。
鄭芝龍者，閩人也，為日本婿，家於臺灣。日本之東歸也，芝龍以舟楫人眾橫於海。大清順治二年，芝龍自安平奉表降，其子成功逃入海。晚年，率舟師數百艘攻臺灣，荷蘭寡不敵，遂去而伺於葛留巴。臺灣人猶有習其教者，曰「教冊」，成功則盡除之。
康熙初，鄭克塽降，廷議棄臺灣。施琅力爭曰：『是資荷蘭也』！卒置郡縣，功施至今。
附錄三日本乞師記（黃宗羲「行朝錄」一則）
明季海盜有周崔（鶴）芝者，福清人也。少讀書不成，去而為盜於海。其人饒機智，嘗往來日本，以善射名，與日本之薩摩島主結為父子。日本三十六島，每島各有王統之。其所謂東京者，乃國主也；國主曰京主，擁虛位而已。一國之權，則大將軍掌之；其三十六國王，則如諸侯之職。薩摩王於諸島為最強，王與大將軍為首尾。崔（鶴）芝既熟日本，故在海中無不如意。久之招撫，以黃華關把總稽察商舶。
乙酉秋，唐王隆武加水軍都督，副黃斌卿駐舟山。其冬，崔（鶴）芝遣人至薩摩島，訴中國喪亂，願假一旅，以齊之存衛、秦之存楚故事望之。將軍慨然約明年四月發兵三萬，一切戰艦、軍資、器械，自取其國之餘資，供大兵中華數年之用。自長琦島至東京三千餘里，馳道、橋梁、驛遞、公館，重為修輯，以待中國使臣之至。崔（鶴）芝大喜，益備珠璣玩好之物以悅之。參謀林籥舞（一作學舞）為使，期以四月十一東行。籥舞將解維，而斌卿止之曰：『大司馬余煌書來曰：「此吳三桂乞師之續也」』！崔（鶴）芝怒而入閩。
福州既破，鄭芝龍降。丁亥三月，崔（鶴）芝克海口、鎮東二城，遣其義子林皋隨安昌王至日本乞師，不得要領而還。
戊子，御史馮京第謀於黃斌卿，偕其弟黃孝卿往日本。至長琦島，其王不聽登陸。始有西洋人為天主教者，入日本作亂於其國。日本勒兵盡誅教人，焚其船於島口，絕西洋人往來。於中衢置銅板，刻天主教像於其上以踐踏之。囊橐有西洋一物，搜得必殺無赦。西洋人復以大舶載砲，來與日本為難，日本拒之，甫退一日，而京第至，故戒嚴同於外國。京第效包胥故事，於舟中朝服拜哭不已。會東京遣官行部，如中國巡方御史，禿頂坐籃輿，京第因致其血書。薩摩王聞長琦王之拒中國也，曰：『中國喪亂，我不遑恤，而使其使臣哭於我國，我國之恥也』！與大將軍言之，議發各島罪人出師。京第還，日本致洪武錢數十萬。蓋其國不自鼓鑄，但用中國古錢；舟山之用洪武錢由此也。而黃孝卿假商舶留長琦島。長琦島多官妓，皆居大宅，無壁落，以綾縵分為私室。當月夜，每室懸各色琉璃燈，諸妓各賽琵琶，中國之所未有。孝卿樂之，忘其為乞師而來者，見輕於其國，其國發師之意益荒矣。
己亥冬，有僧湛微自日本來，為盪胡伯阮進述請兵不允之故，且言『金帛不足以動之。日本最敬佛經，誠得普陀山藏經為贄，則兵必發矣』。進與定西侯張名振上疏監國，以澄波將軍阮美為使。王親賜宴。十一月朔，出普陀。十日至五島山，與長琦相去一程。是夜大風，黑浪兼天，兩紅魚乘空上下，船不知所往。十二日見山，舵工驚曰：『此高麗界也』。轉帆而南，又明日乃進長琦。
凡商舶至國，例撥小船稽出入，名曰班船。阮美喻以梵篋乞師。其王聞之大喜。已知船中有湛微者，則大駭。初，湛微之在日本也，長琦島有三大寺：一曰南京寺，中國北僧居之；一曰福州寺，閩浙廣僧居之；一曰日本寺，本國人居之。南京寺住持名如定，頗通文墨，國人重之，湛微拜為師。湛微所能不若師，而狡獪多變。乃之一島名■〈月斐〉泉者，其島無中國人往來，不辨詩字之好醜，湛微得妄自高大。惡札村謠，自署金獅子尊者，流傳至東京，大將軍見之曰：『此必為西洋人之為天主教者潛入吾國』，急捕之。既知其為江西僧，逐之過海。日本不殺大唐僧，有犯法者止於逐，再往則戮及同舟。湛微欲以此舉自結於日本。於是阮美始知為其所賣也，遂載經而返。
然日本自寬永享國三十餘年，母后承之，其子復辟，改元義明，承平久矣。其人多好詩書、法帖、名畫、古奇器。十三經、十七史，異日值千金者，捆載既多，不過一、二百金。故老不見兵革之事。本國且忘，豈能渡海為人復仇乎？即無西洋之事，亦未必能行也。
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