臺灣懸大海中，北界彰化之雞籠城（在縣極北海中），南界鳳山之砂馬磯（縣東南二百三十里），縱輪近三千里；東背山，西面澎湖（島，在臺灣縣西五十里海中，臺灣廢城在今縣西南）。舊稱澎湖之東為毗舍邪國，或曰毘舍那國；袒果睢于，習鏢弩。宋淳熙閒，嘗有酋眾肆掠泉之水澳（寨，即永寧衛）、圍頭（鎮，在晉江縣南一百里）等處。明嘉靖間，都督俞大猷嘗迫海寇林道乾於澎湖。道乾窮入臺，不樂其土，恣殺番眾，以血膏艇，棄之占城。而臺地之闢，實自鄭芝龍父子。
芝龍，南安人。父紹祖，為泉州府胥。芝龍嘗兒戲，擲瓦牆外，誤中知府蔡善繼冠，折左翼；趣執，既至，奇其狀而縱之。長益矯不羈。道廣東香山澳，傅市舶之日本。豔翁氏女，年十七，暱焉不反。
會海澄亡命顏思齊為甲騾，蓋彼夷所立之統華人者也，豐積好施貸；與晉江販者楊天生善。天生謂：『日本達閩、粵、遼、句驪，得之可以自大』。轉鳩洪升、陳德、張宏、陳勳等二十八人，長思齊，而芝龍年少為之殿。日本故於海隘置砲臺，列卒更戍。因謀閒不意，脅殺戍者，還砲車內嚮，發徒眾縱火板屋，乘昏夜襲取要害，分奇席捲。隱祈天地盟，約定天啟四年夏六月將發。
翁氏婦夢巨魚觸膺，生子，男也；眾往賀，因誡芝龍勿疏秘於婦人。曰：『何至是？是非夫矣』！而同盟李英已醉，不謹；妻倭女王氏覺告，而翁氏父翼皇先奔告芝龍曰：『殆已！王兵將至』！乃速思齊等駛大艇乘風遯。已脫，凡艇十三。思齊欲之舟山（今定海縣），陳德謂：『密邇鄉土，各歸耳，難有固志；不若風利駛臺灣便』。僉曰：『善』。八晝夜乃至，計撫土番，立寮寨，以時出獵海上。時紹祖已先死，其群從子姓歸者踵接。
而思齊以五年秋九月獵諸羅山反，病死。咸薦於皇天后土，卜以磁質杯二，曰：『邦伯不祿，莫長莫君，天庶新造，賚一人以乂受祐那哉，則一俛一卬而無小損者從』。祝已，乃次年擲杯。眾罔協；末至芝龍，允如祝。眾噩曰：『盍再』！乃數十試，皆俛卬協且完。眾讙曰：『天與之！眾庇之矣』！柬六年春正月旬有八日受終；芝龍固辭乃就。令曰：『戔戔懼不勝，敦顏駕茲，弗政曷俾？孰綱紀黜賞惟平，孰斤農食居者行者咸賴，孰司工肆庀廬艦甲兵惟良，孰修律度書識別旂表惟察，孰肄戰陳進止坐作攻守惟備，敦典祭賓、飾辭令、盛聲容、豫占候、巽條故咸周，孰安上下、徠豪俊、堲邪■、納規誨克均無隱。其柬十八人任仔棐予以符旬有八日之應。上帝享予咸休，其或不享咸劉；咸其戒哉！命不貳柬！不以實受而僨不濟者差罰勿赦。柬而身覺不任者讓免』。芝龍乳字一官，至是更焉。更其弟芝虎、芝豹、芝鵬、芝燕，餘十三人皆以芝敘。
二月，以楊天生、洪升參軍事，楊經、李英總饟軍，陳勳、林翼督造戰艦，陳德、張宏為監軍。芝龍帥艇十（艇各軍士六十）、偵事艦二（艦各二十五人），儲一月糧，於三月犯金門（即浯洲嶼，同安縣東南五十里海中），又犯廈門（即嘉禾嶼，同安縣西南五十里海中）。夏四月，犯廣東靖海（在潮之惠來縣東少南六十里）、甲子（舊在惠之海豐縣東南一百五十里，今陸豐縣東南一百里）二所。所設指揮千百戶轄軍士，無御寇者，徒馳羽檄報寇埶鋒盛不可當；當事悚慴上聞。或以蔡善繼嘗善芝龍，說巡撫為招安計；即起善繼泉州巡海道，持撫臣朱欽相檄，遣旂鼓黃昌奇入海。芝龍方燖滌戰艇於湄州（在莆田縣東南九十里海中），稔昌奇故亦泉府胥，與紹祖善，重不忍違善繼意，允就撫。而陳德等皆不欲，乃別六艇遣還臺灣傒後命。而自與群從統十二艇、眾八百餘人，入泉州港謁蔡。會欽相疾，月餘不報。芝虎因說曰：『撫臣意不測，速去之便』。芝龍猶豫，且重負蔡。虎又曰：『書生耳弇事體，不速將及』！即夕駕汐出泊圍頭外灣。部群從厲兵攻海豐，下之；又攻嵌頭（莆田縣東六十里）。又連破甲子、靖海二所。
七年春正月，還泊漳浦之舊鎮（縣東南）。巡撫朱一馮檄都司洪先春等會戰於將軍澳（縣東南）。先春還舊鎮。芝龍屯六鰲外嶼（縣東南七十里），偵先春檄調鎮海（衛城，在縣東北一百里）、懸鐘（銅山西南，詔安縣東南四十里）、銅山（陸鰲西南，詔安縣東八十里）、六鰲（鎮海西南）各衛所軍士，兼募沿海鄉勇。芝豹夜率二百人，持海豐所獲鄉勇旂幟，乘岸雜鄉勇中以待。越日，先春出港口戰，芝虎不勝。芝豹起岸上夾擊之，先春大敗，遯金門。一馮即令金門遊擊盧毓英會剿。芝龍令群季佯為商舶並小艇，唱漁歌，分伏島嶼閒；而自領數艇迎戰。毓英少之。芝龍復佯敗。毓英駛進，伏出，弓弩齊發，遂擒毓英。芝龍以禮遣還，屬道嚮者就撫意。毓英還廈門，謁都督俞咨皋，言芝龐可撫狀。咨皋者，大猷子也，怒責毓英。毓英至泉，復以可撫狀告知府王猷。猷心是之。而咨皋巳至一馮所，罪毓英失機，繫獄。更檄千戶馬勝、百戶楊世爵擊芝龍，至將軍澳中伏皆死。咨皋又檄副總兵陳希范遏戰於杏仔，又敗，洪應斗、張選舉沒焉。咨皋大慚；調閩安（鎮，在縣東四十里）、興化、永寧（衛城，在晉江縣東南六十里）、銅山、六鰲、懸鐘、鎮海、金門諸將會議中左所（即廈門）。芝龍偵諸將惟王飛熊、林盛、李夢斗精水戰，餘子碌碌不足數，乃分十艇為前鋒，分八艇出青水溝，約日中由東碇會；分四艇左右翼，而自帥中軍六艇策應，夜先發。及旦，遇咨皋軍。芝虎鼓前鋒壓之，戰林盛、李夢斗，至日中不決。芝龍乘閒橫擊。而東碇艇新軍奮起，咨皋急麾分敵，而諸將誤謂退師，遂大亂。芝龍縱擊。軍將溺失無算，咨皋遯入廈門，遽令指揮傅珪統十五艇抵御南山。芝龍至，又大敗之。咨皋遯三汊河（在舊鎮東北、龍谿縣東南）。先是朱欽相撫海寇楊六、楊七，咨皋實主其議。及中左之戰，皆率眾先遯。漳州工科給事中顏繼祖劾咨皋、希范，逮問。
崇禎元年，王猷復以撫議說巡撫熊文燦。文燦下巡道鄧良知議。問誰可使芝龍者，猷以毓英對。即白文燦，自獄中釋之使往。方是時楊六、楊七叛烏洋，劉香老擾惠、潮、南澳（在詔安縣西南百餘里、饒平縣東南一百六十里海中，有三城，去懸鐘澳口三十餘里），褚彩老劫沿海，李魁奇攻掠澎湖、遼羅等處，最橫。魁奇，惠安漁人，能竟日行水中。初聚眾澎湖，候劫呂宋國船。陳德等回臺灣，聞芝龍受撫不決，以眾來會；至澎湖，為魁奇所劫，德及楊天生等皆死，免歸臺灣者惟李英與通事何斌。芝龍聞之，大恚。秋九月，毓英說芝龍降；遍賂當事，皆喜。遂詐以義士鄭芝龍收復鄭一官奏聞（一官，芝龍乳名，詳見前），官為防海遊擊，復盧毓英監其軍。芝龍曰：『世無君子，天下皆可貨取耳！陳平之閒項也，黃金勝百戰矣』。
二年夏四月，芝龍攻殺魁奇於遼羅，取其首祭陳德等，盡降其眾。六月，遂斬楊六、楊七於浯洲港（即金門）。秋八月，褚彩老寇閩安，芝龍追滅之於南日（山，在興化府城東百里大海中）。
三年夏五月，遣弟芝燕往日本迎歸翁氏及所生子，而倭婦先未有入中地者，不許。芝龍命統戰艦數十逼竟上，乃以所生子先歸，年七歲；芝龍喜其貌偉，名之曰森，字曰大木。能讀書，稍長，通春秋左氏傳及孫吳兵法，喜擊劍馳射。時時東嚮咨嗟念母氏。諸昆弟或有侮之者，獨叔父鴻逵深器焉。事諸母趙氏，無閒。年十五，補南安縣學生。
香老寇小埕（寨，在連江縣東百二十里，南接南日山，為連江門戶），芝龍擊之，遯；再寇長樂及海豐。當事以撫芝龍故事遣惠潮分守道洪云蒸、巡道康承祖、參將夏之木、張一傑入海招香老；需重賂，皆被執。
八年春三月，兩廣總督熊文燦、福建巡撫鄒惟璉檄芝龍討之。香老時屯甲子，脅云蒸同舟距師。夏四月，遇於田尾洋（當即田尾澳之外洋，澳在碣石衛西門外，可泊），出云蒸以撼芝龍。云蒸大呼曰：『當事非夫，我則死，急擊勿失』！香老怒刃之，遯。是夜芝龍泊赤澳（即赤嶼，近南澳），計香老必乘潮至，令芝虎、芝豹伏眾艦前澳（當即錢澳，在潮陽縣東南二十里，碣石在甲子西，甲子東為錢澳，又東為赤澳，赤澳近柘林），浮水寄椗。已而果至，大戰至日中。芝虎手盾口利刃援登檣巔，近香老大艇，躍而過，搏將刃之；左隊艦未之見也，然砲擊大艇，虎與香老俱焚死。芝龍盡俘其眾還。承祖、之木、一傑求芝虎尸，五日不得，大慟，徒招以祭。
十二年夏六月，荷蘭國將郎畢吉里哥連犯閩、浙，所至莫御，號曰紅夷軍。夷精機巧，用火器多奇中；乘巨艦曰夾板，堅質密護，銃砲矢石無所施，故我軍卬攻多敗失。芝龍奉檄，令芝豹柬善泅水軍，要瓠筩，乘小艇，實茅薪、神煙、砲石、神沙、毒火，而艇之首腋錠狼牙銳釘，相風水埶駛抵彼艦，不可拔，然火，浮水逸。因是焚其五艦，餘遯去。或表芝龍累多前虜於朝，且善制敵，乃進總兵，再進福建都督。鴻逵授副總兵，鎮南安、贛州。
荷蘭國王之弟曰揆一王，因郎畢吉里哥敗歸，請再舉；不許。請中占一島地以通往來，伺閒隙；乃許。揆一王略地至臺灣，遇何斌，喜甚，命為甲螺。度形勝，築城於七鯤身（山，在鳳山縣西北，自打鼓山穿田過港逶迤六十餘里，平地中結為七峰，如鯤魚鼓浪，故名）之首，曰臺灣，城外列砲臺；更築小城於對岸，曰赤嵌城（屬臺灣縣）。
十七年春三月，京師陷。夏五月，福王立於南京，以明年為弘光元年。封芝龍南安伯，鎮福建；鴻逵靖鹵伯，充總兵官守鎮江；芝豹、彩並充水師副將。芝龍遣兵衛南京。子森入太學，說錢謙益以知人善任、招攜懷遠、練武備、足粻貯、決壅蔽、埽門戶。曰：『少更事，知之易，行之難』！曰：『行之在公等。度不能行則去，能不我用亦去；此豈貪祿位、徒事粉飾地邪？能將將，伊、呂一人；能將兵，虎賁三千足矣。不能，多益擾，衽席閒皆流寇也』！謙益心畏而謝之。
大清順治二年夏四月，大軍自歸德道泗逾淮，克揚州，獲史可法，不屈死。五月，鴻逵以水師守瓜州，曹總兵守儀徵，距大軍北岸三日。大軍分舟潛由運河達南岸，陳於江之西，距瓜州十五里絓鴻逵，而別以舟師夜濟。未至南京，福王先率馬士英及眾閹潛遯。既至，大學士王鐸、禮部尚書錢謙益並忻城伯、魏國公等一百五十六大員、馬步兵二十三萬八千三百迎降。大軍自徐州進者，敗劉澤清、高佑於宿遷；進清河，又敗澤清、馬化豹等於淮、黃、清三河口；入淮安界，降范鳴珂；進次清江，澤清、田仰遯走，柏水馥率兵出降，遂克淮安，鳳陽、廬州望風降，福王遯太平。六月，復走蕪湖；黃得功戰死，田雄、馬得功縛王及妃以獻。十總兵並率眾降。鴻逵自鎮江奔杭州。潞王監國三日，出降。紹興淮王渡江降。繫周王眷屬於湖州。總兵王之仁率兵二千五百人降。捦桂陽王於和州。
鴻逵奉唐王入福州，改元隆武，閏六月丁未日（二十七日）也。芝龍、鴻逵晉伯為侯，芝豹、澄濟伯，彩、永勝伯。鄭森賜姓朱、名成功，提督禁旅，以駙馬、都尉禮從事。黃道周為大學士，蘇觀生、張肯堂、吳春枝為尚書、侍郎。開儲賢館，定十二科取士。芝龍議自仙霞關外當守者百餘處所（仙霞嶺在衢州府江山縣南一百里，南去浦城一百二十里，有關），先為不可敗以規進取；又議以明年春出關。計戰兵二十餘萬，統閩、粵正供，不足一年之食；饟絀，人無固志，虛名假義，不可以空腹爭也。時新進者希樹功以駕鄭氏，文大臣亦疾鄭氏之擅，諷隆武趨出關，圖恢復。芝龍對曰：『戰、危事，非策萬全不可』。會宴大臣，芝龍意侯爵可位文臣上；道周曰：『祖制，武臣無右』。芝龍謝不敏，讓居下；而環睹皆鄭氏宿將，不平甚，芝龍目止之。終宴，諸生疏言：『道周等迂闊無能』。隆武敕督學御史遍抶之。芝龍、鴻逵數援引親舊，不聽用，意鞅鞅若失。尚書何楷劾芝龍引疾不陪祀南郊，無人臣禮；隆武獎楷好風裁，令掌都察院事。鴻逵偶搖扇殿上，楷面呵之。
秋九月，大軍克徽州，右僉都御史金聲死之。冬十月，道周統兵至婺原，潰。婺原令、道周之門人也，紿為內應，信之；至明堂里，為大軍張天祿所執，死，蓋洪經略教也。何吾騶、曾櫻并為大學士。隆武擇日親征，命芝龍、曾櫻留守；鴻逵御營左先鋒，出浙江；彩右先鋒，出江西。為壇西郊，行推轂禮。鴻逵出城，馬仆地。隆武方秉鉞誓師，風暴起，旂靡，天帝及高皇帝前燭滅，三軍土色。十二月甲申（初六日）啟行，丙午（二十八日）駐建寧。
三年春，貝勒博洛、固山額真公圖賴征福建、浙江，洪承疇經略如故。隆武懼，將出汀入贛，引湖南何騰蛟為援；芝龍諫止，駐延平。封成功為忠孝伯。潞安王、瑞昌王以眾二萬入江寧（南都改府），不克。闖賊李自成偽總兵馬進忠、王進才自岳州叛，奔何騰蛟。隆武封騰蛟定興侯。騰蛟率眾圍荊州，貝勒勒克德渾馳破之，降自成弟李孜、偽磁侯田見秀等馬步兵五千餘人，獲玉璽一；隆武賜李錦名李赤心（賊號一隻虎）、自成妻弟名高必正，及進忠、進才、郝永忠（原名搖旂）、張光翠、袁應第、牛萬才、張光璧等十餘營皆隸騰蛟，受節制。承疇大索潛山、太湖閒，殺樊山王朱常■〈巛上水下〉及石應璉等。
三月辛未（二十四日），大軍破吉安。初，汀、邵閒有大帽（山名）洞蠻，永寧王誘之同據撫州，博洛分軍圍撫。時彩軍屯廣信，永寧請救；遣張家玉以三營往，圍解。已而大軍復合。夏四月，彩聞博洛道衢州，將至，遂棄廣信入關（岑陽關，在上饒縣東南一百二十里，東去浦城縣二渡關三十里，界廣豐、崇安之閒；二渡關在浦城縣西北一百十里）。撫州破，永寧死；彩削爵，待罪江西。督師萬元吉自吉安退守張家渡，又退守皂口。監紀程亮以新威營援師二百人下守綿津灘。壬午（初六日）新威營潰，元吉奔贛；贛督師，蘇觀生也。丁亥（十一日），粵遣副將吳之蕃、遊擊張國祚以兵五千人援贛。庚寅（十四日），博洛軍至，觀生退守南康。是時滇、粵先後援贛者累數萬，士望北軍皆股慄，莫敢一戰。乙巳（二十九日），閣部楊廷麟厲各營兵尚四萬餘人，劉廣■〈胤，去 乚〉自寧都募二千人亦至，皆先後潰。五月丙午朔，廣■〈胤，去 乚〉被執。博洛軍抵浙，江水涸，經渡數十騎，而列戌驚潰，走死不暇矣。監國魯王由紹興遯舟山，肅鹵伯黃斌卿不納。會鄭彩至，奉之入閩。六月，鴻逵自浙還浦城。隆武疾彩奉魯王，並削鴻逵封爵。先是，魯以都督陳謙使隆武，御史錢邦■〈苊，去厂〉以謙與芝龍有舊，慮他變，請殺之。芝龍亟請解官貸謙死。隆武故留芝龍語，及出，謙殊死矣。
晉江人黃熙允故厚芝龍，以洪承疇舉為福建招討使，又謂貝勒曰：『唐藩弱，離鄭氏，乃匹夫耳；不如紿以三省王芝龍，使內附』。乃多為閒書投芝龍。秋七月己巳（二十五日），隆武由關上主事所搜獲勸鄭氏迎降書二百餘緘；承疇又偽為芝龍允獻隆武、彩讞魯王書泄之隆武左右。鄭氏因人人自危。隆武亦惡其不遐棄也，日思遠鄭氏為全身策；成功因以母疾辭還安平（鎮，在晉江縣西南六十里）。守關將施天福等知有內變，皆撤兵先後去。
八月，大軍破仙霞關，獲閣部黃鳴峻等。進破浦城，殺楊廷清、李喧等，遂下建寧、延平等府。庚子（二十七日），隆武奔汀州，追騎及之，死。芝龍時守泉州，與芝豹籌饟。貝勒兵卒至，眾潰。翁氏婦初由日本至，死焉。芝龍退保安平。貝勒使郭必昌招芝龍曰：『我出師平閩、浙，數月間悉底就功，負一隅何恃？速來，鑄兩粵總督印待足下！緩須臾，無及』。芝龍遂劫眾奉表出降。成功叩馬諫曰：『海內思漢官威儀，出於其性，無賢愚恥作蒼頭奴。李、張二賊窮蹙，不日死。崛起巢穴半書生，又所嚮無所得食，故忽起忽滅，若云掣電。明宗室無伯升昆仲才，不足奉。隆武埶既孤，大抵走死，願大人勿虞。北人性習與人殊，詐利反覆不可信。大人設險以守，觀釁而動，逸則進，勞則退，天不厭明，擇可立而立之；否則，終老海濱，差可自快』。弗聽。鴻逵諫曰：『兄位極人臣，帶甲數十萬，舳臚蔽海，糧積齊山，以此號召天下，何所不可？委身而事，自比琉球奉正朔可矣。且三省王爵頓易兩廣總督，偽立破。兄以此辭，不然必悔』！又弗聽。成功泣曰：『魚不可脫於淵也，大人三思』。芝龍拂衣起，去。成功遯歸金門（海，自泉江口西南至金門百餘里，金門西至廈門百里，廈門西南至南澳四百餘里）。貝勒遂挾芝龍北去。
冬十月，大軍破贛州，楊廷麟、萬元吉投水死。初，隆武封第四弟（聿■〈金粵〉）為唐王，隆武死，乃浮海至粵。瞿式耜等已奉桂王（由榔）監國肇慶；蘇觀生從贛入廣，與何吾騶等立唐王廣州，改元紹武。十一月，大軍破廣州，王及觀生自縊死，吾騶等降。彩由廈門奉魯王次長垣，改明年魯監國二年。成功自仍隆武舊朔。肇慶踰年改元永曆，海上遂有三朔。
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