东汉郡国名称大体恢复西汉旧制,不过也有一些变动与增减。开国初期,由于战乱以后人口锐减,所以并减较大,后来又逐渐增置,与西汉相比,值得重视的有以下各点:
西汉的13个刺史州仅是监察区,不是郡上的一级政区。后汉,特别是在黄巾起义阶段,朝廷不派刺史而派权位很高的人去坐镇某地,主管并处理州内的政务,称为州牧,而不称刺史,这样牧即成了郡上一级的行政长官,从而形成了州、郡、县的三级政区体系。
东汉朔方刺史部并入并州刺史部,可是又让首都所在的司隶校尉部与州平行,所以西汉、东汉都保持有13部的名称。
东汉建都于洛阳,以长安为西都,刘秀兴起于南阳郡宛县,以南阳作为南都,因而又有了三都的称号。
前后汉时王国、侯国变动较大,撤建有所不同,有的名称改变,有的境域调整,值得注意的东汉还有公国的设置,例如汝南郡有宋公国(在今安徽界首县东北),东郡有卫公国(在今河南清丰县东南),实际它们都和侯国辖境相似。
西汉时在边疆地区设有属国都尉,大体与郡同级。东汉安帝时在边境地区设立了犍为、广汉、蜀郡、张掖、居延及辽东六个属国,其下大都领有县或城,地位与郡相似,则和西汉不同。
西域与中原的联系在王莽时一度中断,东汉时经过班超、班勇父子的锐意经营,联系得以恢复。班勇还写了《西域传》一文。当时取道于今吐鲁番盆地的北线日趋重要,比西出阳关沙害较少,班勇曾任西域长史,有可能那时西域都护府已易名为西域长史府。