卷首宋元儒学案序录 卷一安定学案（黄宗羲原本黄百家纂辑全祖望修定）
卷二泰山学案（黄氏原本、全氏修定） 卷三高平学案（全氏补本）
卷二十二景迂学案（全氏补本） 卷二十三荥阳学案（黄氏原本、全氏补定）
卷二十四上蔡学案（黄氏原本、全氏修定） 卷二十五龟山学案（黄氏原本、全氏修定）
卷二十六廌山学案（黄氏原本、全氏修定） 卷二十七和靖学案（黄氏原本、全氏修定）
卷三十刘李诸儒学案（黄氏原本、全氏补定） 卷三十一吕范诸儒学案（黄氏原本、全氏补定）
卷三十二周许诸儒学案（黄氏原本、全氏补定） 卷三十三王张诸儒学案（黄氏原本、全氏补定）
卷三十四武夷学案（黄氏原本、全氏修定） 卷三十五陈邹诸儒学案（全氏补本）
卷三十六紫微学案（黄氏原本、全氏补定） 卷三十七汉上学案（全氏补本）
卷三十九豫章学案（黄氏原本、全氏修定） 卷四十横浦学案（黄氏原本、全氏修定）
卷四十一衡麓学案（黄氏原本、全氏补定） 卷四十二五峰学案（黄氏原本、全氏补定）
卷四十三刘胡诸儒学案（黄氏原本、全氏补定） 卷四十四赵张诸儒学案（全氏补本）
卷四十五范许诸儒学案（全氏补本） 卷四十六玉山学案（全氏补本）
卷四十七艾轩学案（黄氏原本、全氏修定） 卷四十八晦翁学案（上）
卷四十九晦翁学案（下） 卷五十南轩学案（黄氏原本、全氏修定）
卷五十一东莱学案（黄氏原本、全氏修定） 卷五十二艮斋学案（黄氏原本、全氏补定）
卷五十三止斋学案（黄氏原本、全氏补定） 卷五十四水心学案（上）
卷五十五水心学案（下） 卷五十七梭山复斋学案（黄氏原本、全氏修定）
卷五十八象山学案（黄氏原本、全氏修定） 卷五十九清江学案（全氏补本）
卷六十说斋学案（全氏补本） 卷六十一徐陈诸儒学案（全氏补本）
卷六十二西山蔡氏学案（黄氏原本、全氏补定） 卷六十三勉斋学案（黄氏原本、全氏修定）
卷六十四潜庵学案（黄氏原本、全氏修定） 卷六十五木钟学案（黄氏原本、全氏修定）
卷六十六南湖学案（黄氏原本、全氏补定） 卷六十八北溪学案（黄氏原本、全氏修定）
卷七十一岳麓诸儒学案（黄氏原本、全氏补定） 卷七十二二江诸儒学案（全氏补本）
卷七十三丽泽诸儒学案（黄氏原本、全氏补定） 卷七十四慈湖学案（黄氏原本、全氏补定）
卷七十五絜斋学案（黄氏原本、全氏补定） 卷七十六广平定川学案（黄氏原本、全氏补定）
卷七十七槐堂诸儒学案（黄氏原本、全氏补定） 卷七十八张祝诸儒学案（全氏补本）
卷七十九丘刘诸儒学案（全氏补本） 卷八十鹤山学案（黄氏原本、全氏修定）
卷八十一西山真氏学案（黄氏原本、全氏修定） 卷八十二北山四先生学案（黄氏原本、全氏修定）
卷八十三双峰学案（黄氏原本、全氏修定） 卷八十四存斋晦静息庵学案（全氏补本）
卷八十五深宁学案（黄氏原本、全氏补定） 卷八十六东发学案（黄氏原本、全氏补定）
卷八十七静清学案（黄氏原本、全氏补定） 卷八十八巽斋学案（全氏补本）
卷八十九介轩学案（黄氏原本、全氏修定） 卷九十鲁斋学案（黄氏原本、全氏修定）
卷九十一静修学案（黄氏原本、全氏补定） 卷九十二草庐学案（黄氏原本、全氏修定）
卷九十三静明宝峰学案（黄氏原本、全氏补定） 卷九十四师山学案（全氏补本）
卷九十五萧同诸儒学案（全氏补本） 卷九十六元佑党案（附《绍兴学禁》）
晦翁文集
自圣学不传，世之为士者不知学之有本，而惟书之读，则其所以求于书，不越于记诵、训诂、文辞之间，以钓声名、干禄利而已。是以天下之书愈多而理愈昧，学者之事愈勤而心愈放；词章愈丽，议论愈高，而其德业事功之实，愈无以逮乎古人。然非书之罪也。读者不知学之有本，而无以为之地也。（《福州州学经史阁记》。）
人之所以位天地之中而为万物之灵者，心而已矣。然心之为体，不可以闻见得，不可以思虑求，谓之有物则不得于言，谓之无物则日用之间无适而非是也。君子于此，亦将何所用其力哉﹖「必有事焉而勿正，必勿忘，勿助长」
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